極性改性色譜柱在使用高水相分離極性化合物時易發生孔內去濕現象，提供了可替代選擇。能夠有效保留各類極性化合物，并改善極性化合物的色譜峰形，尤其是對堿性化合物的拖尾而言，具有明顯改善作用。
極性改性色譜柱的平衡：
由工廠測試后是保存在乙腈/水中的。
請一定確保分析樣品所使用的流動相和乙腈/水互溶。每天用足夠的時間以流動相來平衡色譜柱，您就會在處理問題方面獲得最大的"補償"，而且色譜柱的壽命也會變得更長！操作步驟：
a、平衡開始時將流速緩慢地提高，用流動相平衡色譜柱直到獲得穩定的基線（緩沖鹽或離子對試劑流速如果較低，則需要較長的時間來平衡）。
b、如果使用的流動相中含有緩沖鹽，應注意用純水"過渡"即每天分析開始前必須先用純水沖洗30分鐘以上再用緩沖鹽流動相平衡；分析結束后必須先用純水沖洗30分鐘以上除去緩沖鹽之后再用甲醇沖洗30分鐘保護柱子。
長期保存極性改性色譜柱：
如色譜柱要長時間保存，必須存于合適的溶劑下。對于反相柱可以儲存于純甲醇或乙腈中，正相柱可以儲存于嚴格脫水后的純正己烷中，離子交換柱可以儲存于水中，并將購買時附送的堵頭堵上。儲存的溫度最好是室溫。
在使用中常見的問題：就是柱壓升高，如果柱壓是在長時間使用過程中緩慢增加，屬于正常現象。但柱壓在使用過程中突然升高（系統管路堵塞及壓力傳感器故障除外），可能的原因有如下幾點：
（1）過濾篩板堵塞或污染；
（2）填料被樣品污染；
（3）色譜柱內緩沖液中的鹽遇到高濃度的甲醇或其他有機溶劑，形成結晶析出；
（4）流動相pH值過大或過小使固定相結構破壞或溶解。
